首先考虑猪流行性腹泻；该病多发于育肥猪、哺乳猪，哺乳猪最为严重，主要发生于寒冷季节。病猪是最主要的传染源。肠系膜淋巴结和肠绒毛上皮细胞是猪流行性腹泻病毒的常聚地，病毒随粪便批出后，通过污染猪饮水、饲料、饲喂工具等感染猪群。
仔猪反复腹泻的原因
它会陆续不断的感染因断奶失去母源抗体的断奶仔猪，从而造成了猪流行性腹泻成为地方性流行的特性，反反复复很难治愈，猪流行性腹泻一般会5-8周龄断奶仔猪的顽固性腹泻。除此以外，还有以下原因会引起仔猪腹泻：
1、生理阶段；
仔猪的肠胃处于发育阶段，肠道功能比较弱，消化吸收能力差，如果有换料、断奶等应激出现容易发生腹泻；
2、肠道菌群变化；
仔猪肠道正常菌群还未建立，自我保护能力比较弱。发生断奶后有益菌比例急剧下降，而有害菌的比例增加，使肠道微生态失去平衡，破坏肠道健康，到了夏季各种病原微生物繁殖较快，此时大量有害菌的繁殖导致腹泻；
3、断奶；
母猪奶水的多少也影响着仔猪是否有腹泻，仔猪遇到断奶导致出现生理和心理上的应激，来自初乳的保护力和母源免疫下降，由于发育不完善，影响自我调节能力和肠道的自我修复功能。
4、其它应激；
还有外界环境、管理等多方面的应激，饲料饮水品质等。
5、母猪未免疫，
母猪没有注射流行性腹泻疫苗，是导致仔猪和育肥猪发病的主要原因。仔猪一旦有感染，很容易造成流行，最终成为顽固性腹泻，更加大了治疗难度。
仔猪腹泻的防治，需要从调节改善仔猪脾胃功能、肠道免疫系统功能，以及恢复和建立肠道菌群的平衡等方面入手。
