水稻不同品种对各种病毒及其介体的抗性有明显差异，但现有主要栽培品种一般多不抗病。水稻苗期至分蘖期比较感病，拔节后抗性日增。
水稻病毒病的发病条件
稻田前作种植感病寄主作物，田间杂草丛生，单、双季混栽，早、中、晚熟品种插植，早播早稻，单本稀植，都会给传毒昆虫和毒源的积累造成有利的稻田生态条件，从而有利于病害的发生和流行。
冬春温暖，水稻生长前期高温干燥，有利于越冬代和稻苗生长期间传毒介体的生存和活动，促进病毒的传播和蔓延。
水稻病毒病的流行取决于各种病毒的有效毒源；
相应介体种群的数量、活力及其传毒效能；水稻品种对病毒及其介体的抗性；介体迁移传毒高峰与感病稻株易感病生育期的吻合程度；生物的和非生物的环境因子。
多数水稻病毒病在同一地区一般很少连续数年严重为害，年际间的流行具有明显的间隙性。针对各种水稻病毒病的流行特点，从多年来（至少10年以上）病害流行相关因子的调查研究中，筛选流行的关键因子，运用相应函数关系，可组建一种或数种病毒病的流行预测式。在双季稻区，一般都以晚稻发病比较严重，因此，预测重点应放在双季晚稻上。
针对各地病毒病发病和流行特点，因时因地采取合适的措施。主要有一下几点：
1、改进耕作制度
如水稻黑条矮缩病，于60年代初在江苏、浙江、上海流行。通过小麦改种大麦以及小麦一稻两熟制改为大麦一稻一稻三熟制，有效地控制了该病的流行。
2、选用抗病品种
如水稻东格鲁病，于20世纪80年代初在福建省南部一些地区流行，通过以改换抗病品种（如IR30、汕优30、赤块矮、包胎矮等）为主的综合措施，得到有效的控制。
3、调整播种插秧时期
使易感病的苗期避开介体昆虫迁飞高峰。根据短期测报，结合稻田生态（天敌）、品种和苗情，以及田间管理，做好治虫防病工作。
