储藏小麦，重点是防虫蛀、防霉变、防鼠害等。由于小麦吸湿性能力强，储藏应注意降水、防潮。应充分利用小麦收获后的夏季高温条件进行曝晒，使小麦水分控制在12.5%以下，再行入库。
一、热密闭法
热密闭贮藏小麦，可以防虫、防霉，促进小麦的后熟作用，提高发芽率。
小麦趁热入仓密闭储藏，是我国传统的储麦方法。通过日晒，可降低小麦含水量，同时在暴晒和入仓密闭过程中可以收到高温杀虫制菌的效果。对于新收获的小麦能促进后熟作用的完成。在麦温达到42℃以上，最好是50～52℃，保持2小时，然后趁热放进经晾晒处理的缸或其他储具内，然后用经过消毒的物料进行压盖，最后用薄膜密封储具口，用绳扎紧，不至漏气，使储具内的麦温达到40℃以上，保持8～10天，杀死害虫卵、蛹、幼虫及成虫，从而达到聚热杀虫的效果。
二、低温贮藏法
小麦虽能耐高温，但在高温下待持续储藏长时间也会降低小麦品质。因此，可将小麦在秋凉以后进行自然通风或机械通风充分散热，并在春暖前进行压盖密闭以保持低温状态。低温储藏是小麦长期安全储藏的基本方法。
三、缺氧保管法
缺氧储存主要是利用小麦后熟期长及入缸温度高、呼吸旺盛的特点，在密闭情况下进行的一种自然缺氧保管方法。储具内的氧气随着小麦和害虫及微生物的呼吸而逐渐减少，5～10天即能使氧气浓度降到2%～5%，二氧化碳浓度增加到40%～50%，保持一段时间可使害虫窒息死亡。需要特别注意的是，小麦水分应控制在12.5%以下，平均粮温应保持在30℃以上。
