部分品种感病严重，特别是高赖氨酸玉米和糯质、甜质及结构疏松的粉质型玉米；
1、品种影响；
部分品种感病严重，特别是高赖氨酸玉米和糯质、甜质及结构疏松的粉质型玉米；“青秆成熟”，果穗直立、花丝多、苞叶长而厚、籽粒排列紧密、穗轴含水量高、水分散失慢的玉米品种更易感病。果穗花丝少、苞叶薄、不开裂、收获前成熟下垂的品种，雨水不易淋入，抗病性好。
2、气候影响；
在温度15℃~28℃，相对湿度75%以上时有利于病菌侵染和流行。高温多雨多湿及玉米虫害发生偏重的年份，穗腐和粒腐发生严重，9月~10月降雨及阴天天数较多也是发病关键。穗腐病发生程度与生长季降水量呈正相关，生长季降水量高有利于病原菌的扩散和蔓延，从而使穗腐病加重，降水量小则发病轻。
3、害虫侵染；
害虫活动有助于玉米穗腐病菌的侵染，为从空中传播而来的真菌分生孢子和菌丝提供感染机会，通过生长、繁殖继而侵染正在生长的玉米籽粒。国内玉米穗腐病的害虫主要是亚洲玉米螟和棉铃虫。
4、秸秆还田影响；
秸秆、穗轴、根茬是玉米穗腐病病菌越冬存活的有利场所，未处理的秸秆提供了翌年植株的侵染源，导致玉米穗腐病等病害的发生和加重。
5、品种连作；
同一地块大面积的连作也是引起玉米穗腐病发生的重要原因，品种连作会引起土壤中带菌量每年增加5~10倍，因为作物连作时会使土壤中作物病残体增加，进而增加土壤中次年侵染玉米幼苗的初始菌量。
6、栽培管理不当；
在种植玉米的密度不恰当、肥料施用单一易造成种植密度过大、田间通风透气性差，使田间形成高温小气候，从而为病虫害的滋生创造了条件。另外，提前收割的玉米中含水量较大，又没有及时晾晒极易造成玉米的腐烂和发病。
