饲养过程中，蚯蚓的天敌有鼠、蛙、蛇等。在恶劣的环境条件下如梅雨季节、暴雨及闷热的夏季蚯蚓会逃跑，做好排水工程和防暑降温工作很重要。
虫害防治；
饲养过程中，蚯蚓的天敌有鼠、蛙、蛇等。在恶劣的环境条件下如梅雨季节、暴雨及闷热的夏季蚯蚓会逃跑，做好排水工程和防暑降温工作很重要。此外，饲养密度过大也会引起逃逸。因此，定期检查、适时分养和收取成蚓，不仅能有效防止逃逸，还能显著提高蚯蚓产量。
食盐中毒；
此症发病急，经激烈挣扎后很快麻痹僵硬，色泽趋白。防治方法：立即清除发病基料，并用大量净水清洗，面积大且严重的可把基料连蚯蚓一同浸入净水中，待蚯蚓不挣扎时取出蚯蚓待自然苏醒后放上新鲜基料重新饲喂。
胃酸症；
本病表现蚯蚓痉挛状结节、环带红肿、身体变短粗、转圈爬行或钻到底部不食不动，全身变白死亡，有断节现象。防治方法：立即掀开蚓床覆盖物通风，同时喷洒苏打水或1%新鲜石灰水中和。
缺氧症；
本病蚓体色灰暗无光、体弱、行动迟缓，是缺氧所致。防治方法：揭去蚓床覆盖物通风、检查基料干湿程度并调整到目的干湿度改用腐熟好的基料饲喂。
病害；
蚯蚓的病害主要有：细菌、真菌、病毒三大类。生产中要经常观察群体发育情况，只要发现体软或体硬、变色、有恶臭味、体色异常的个体应及时淘汰，群体发病的要整体淘汰。实践证明采取适当降低蚓群密度，勤除薄饲，分期饲养，保持良好的饲养环境等措施，是提高蚯蚓抗病能力获得高产的关键。生产中应在饲料中添加0.01%土霉素或定期用0.01%土霉素喷洒饲养床面。
养殖过程中要及时清除蚯蚓粪便，清理蚯蚓粪便的目的是减少蚓床的堆积物和收获成蚓，一般1个月清理1次。清除粪便后要及时添加新饲料，以保证饲料充足。
蚯蚓被称为“环保卫士”，处理城乡垃圾；它排出的粪便不仅是优质的有机肥料，还是喂养畜禽鱼虾的高蛋白质饲料。
