牛油果的病害有很多，常见的有炭疽病、疮痂病、尾孢斑点病和小穴壳果腐病。其中炭疽病会危害果实，使其长出凹陷的圆斑，需要通过低温贮藏来防治。疮痂病也会有病斑，不过不会影响果肉品质，可以用波尔多液治疗。尾孢斑点病会导致果实开裂，从而让其它病菌侵入，可用嘧菌酯防治。
一、炭疽病
这是牛油果的重要病害，它对果实的危害能力很强，同时也会感染叶子、花和嫩枝等。患病的果实会先长病斑，直径一般不超过5毫米，形状为圆形。之后病斑会逐渐扩大，而且还会向内凹陷。果实成熟后还会入侵果肉，导致其腐烂。发病期需要将患病的枝叶剪掉，以免其相互传染。果实采收后需要进行低温贮藏，运输过程中还要避免损伤。
二、疮痂病
这种病和炭疽病的情况类似，患病后会出现圆形褐色的突起，之后慢慢变成浅紫色的，等到果实成熟后，中间会凹陷，果皮也会变得粗糙。虽然这种病不会影响它的口味，但看上去很不美观。在发病初期，叶子上会出现棕色斑点，表面皱缩，此时需要将叶子剪除，以免情况继续恶化。同时还要喷洒波尔多液，可以起到治疗效果。
三、尾孢斑点病
尾孢斑点病主要危害叶子、茎和果实，被感染的果实表面会形成枯斑，之后表皮会裂开，这样会导致其它病菌侵入其中，导致果肉的腐败。患病初期，叶子上会出现褐色的斑点，直径在2-5毫米之间，之后变为紫色，而且会扩散到叶子两面，形状也不规则。患病后要及时喷洒铜制剂和嘧菌酯，这样就能有效防治。
四、小穴壳果腐病
这种病在初期会在果皮上出现红色病斑，之后病菌会感染果实内部，果肉上会出现褐色条纹，果蒂周围有紫褐色的病斑。等到它成熟后，病斑就会变黑凹陷，果实也会皱缩，表面会覆盖菌丝体，内部腐烂，并且会散发难闻的气味。发现患病后，要立刻剪除患病的枝梢，将枯枝和病果清除，并且适当施肥，增加它的抗病能力。
