萱草叶基生成丛，枝叶披针形，背面颜色为粉白色。百合基叶互生，形为披针形至椭圆状披针形，叶脉弧形。萱草圆锥花序顶生，花朵比较小。百合花序单生于茎顶，花朵比较大。萱草在中国有八种，百合在中国有46种和18个变种。
一、枝叶不同
萱草叶基生成丛，枝叶披针形，长为30-60厘米，宽为2.5厘米，背面颜色为粉白色。百合株高为70-150厘米，茎比较直立，叶片总数可多于100张，基叶互生，形为披针形至椭圆状披针形，叶脉弧形。
二、花序不同
萱草圆锥花序顶生，花梗长约1厘米，花长7～12厘米，花被基部长2.5厘米，花被6片，花柱细长。百合花比较大，颜色大多为白色，花序单生于茎顶，花期时间在7月。
三、品种不同
萱草在中国有八种，例如有黄花萱草、大苞萱草、童氏萱草、秋红萱草等。而百合在中国有46种和18个变种，例如有卷丹百合、美丽百合、山丹百合、麝香百合等。
四、价值不同
萱草不可直接食用，但具有一定药用价值，具有清热利尿，凉血止血功效。另外其叶子能用来监测环境是否受到氟污染。百合可进行食用，含有丰富营养物质，能起到镇咳祛痰、滋阴润肺作用。
