柠檬薄荷在不同时期浇水的用量，以及浇灌频率都不同。浇水要保持不干不浇、浇则浇透的原则，浇灌所用的水质保证干净清洁，自来水浇灌要先挥发掉氯气。在阴雨季节里做好排水防涝措施，以免根茎被长时间泡水腐烂生虫。
1、不同时期浇水
柠檬薄荷在生长前中期属于发育旺期，需水量较大，浇水用量保障充足，每隔10~15天浇灌一次。到成熟期后就要轻浇，水量稍微控制，避免过湿环境造成柠檬薄荷的倒伏、疯长、落叶等状况。
2、浇灌原则
给柠檬薄荷浇水，要保持“不干不浇、浇则浇透”的原则。毕竟湿润的土壤环境，是柠檬薄荷比较想要看到的，尤其是在生长旺期，更要保持土壤的湿润。冬季比较特殊，尽量保持土壤干湿分明，稍微偏干。
3、水质选择
浇灌所用的水质，可以选用自然界中收集的清洁雨水、雪水等，也可以用纯净水或者矿物质水。家中栽培可用淘米水或自来水。但自来水需要经过1~2日的静置后，挥发掉氯气再使用。
4、雨季排水
柠檬薄荷虽然有一定的耐湿能力，但是阴雨天气下，长时间不进行排水排涝工作，柠檬薄荷的根茎会被长时间泡水，从而出现腐烂生虫的状况，对植株的生长是非常不利的。
